哈佛医学院与牛津大学联手研发AI工具EVEscape:预测病毒变种
划重点:
🔍 哈佛医学院和牛津大学的研究人员开发了一种名为EVEscape的人工智能工具,用于预测病毒如何演变成新的变种。
🔬 研究结果表明,EVEscape可以准确地预测COVID-19的变异,包括在变异发生之前鉴别出变种,以及判断随着病毒变异,哪些抗体疗法将失效。
💉 该工具还能够准确预测其他病毒如HIV和流感的突变轨迹。
哈佛医学院和牛津大学的研究人员合作开发了一种名为EVEscape的人工智能工具,可以预测病毒如何演变成新的变种。研究结果于10月11日在《自然》杂志上发表,表明EVEscape可以准确地预测COVID-19的变异,识别变异前的迹象,并确定病毒突变后抗体疗法的有效性。此工具还有望成功预测其他病毒如HIV和流感的突变轨迹。
研究的高级作者Debora Marks表示:“我们希望知道我们是否能够预测病毒的变异,预测新的变种,因为如果我们可以做到,这将对设计疫苗和疗法非常重要。”
图源备注:图片由AI生成,图片授权服务商Midjourney
最初,研究人员开发了一个名为“EVE”的工具,代表“变异效应的进化模型”。EVE利用跨物种的大量进化数据,来预测导致疾病的基因突变对人类蛋白质功能的影响。这个工具使研究人员能够确定在多种情况下,如癌症和心律失常中,基因突变是良性还是恶性的。
随着COVID-19大流行的发展和病毒的演变,研究人员看到了重新利用EVE的机会,创建了一个新工具EVEscape,可以预测病毒可能变异的最可能方式。Marks在一份新闻稿中说:“我们低估了在压力下和有大量人群的情况下物体突变的能力,病毒是灵活的,它们几乎就像进化了一样。”
EVEscape有两个组成部分,一个是演化序列的生成模型,可以洞察可能发生的病毒突变,这与EVE中使用的模型相同。研究人员还添加了关于病毒的详细生物学和结构信息。结合这两个组件,可以预测病毒变种在出现之前的情况。
研究人员目前正在实时使用EVEscape来检查COVID-19病毒,并识别未来令人担忧的变种,在他们的网站上每两周发布最可能的新变种的列表。该团队还正在努力扩大EVEscape的功能,以包括更多的病毒,如Lassa和Nipah,这两种相对未被研究的病原体有潜力引发大流行。
EVEscape还可以测试疫苗和疗法,评估它们对当前和未来病毒突变的有效性。这有助于科学家设计能够抵御病毒演变的治疗方法。
这一研究有望为疫苗和疗法的未来设计提供宝贵的支持,以确保它们在病毒不断演变的情况下仍然有效。
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